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DeanGao por DeanGao

Python编程基础

二月 2, 2016 Python, 编程开发 por DeanGao

“人生苦短,我用Python”,Python ([‘paɪθɑn])
“Life is short, you need Python!”

Github网址:https://github.com/iwhgao/python_practise

目录:

  • Python简[……]

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Windows下RStudio使用简介

七月 12, 2015 R por DeanGao

1.简介
2.准备
3.安装
4.界面介绍
5.菜单功能介绍
6.使用技巧
    项目管理
    图片浏览
    模块管理
    帮助系统
7.常用快捷键
8.小结

  • 简介

RStudio是RStudio公司开发的R语言集成开发环境([……]

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4.3 Perl编程语言介绍

六月 26, 2015 Perl, 生物信息 por DeanGao

写在最前面:

本节将详细地讲解如何去掌握生物信息学分析中一门常用的编程语言——perl,并结合相应的例子来强化perl编程学习。对于没有计算机编程知识的人来说,学习一门编程语言的过程是痛苦并漫长的,尤其是对学生物的人,

1. 为什么要学编程?
2. 为什么选择perl?
3. Per[……]

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2.4 Linux常用操作命令

六月 4, 2015 Linux por DeanGao

1. 前言
2.文件目录操作
ls——获取文件目录属性
pwd——获取当前工作目录路径
cd——切换工作目录
tree——显示目录结构
file——显示文件类别等信息
mv——移动文件目录或修改文件目录名称
cp——拷贝文件目录
scp、sz、rz——文件传输[……]

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Xshell连接远程服务器图解

六月 1, 2015 Linux por DeanGao

前言
之前说过远程连接Linux服务器的软件有很多种,像Xshell,SecureCRT和Putty,早前我用的是SecureCRT感觉还行,后面接触了Xshell觉得很好用,就一直在用Xshell,下面讲解下如何去连接服务器并进行相应的配置。

下载安装
下载地址:http://cot[……]

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2.3 Linux系统安装(以CentOS、Bio-Linux为例)

五月 28, 2015 Linux, 生物信息 por DeanGao

虽然一般在相应的生物信息学课题组中有人专门负责与Linux系统服务器相关的工作,比如安装系统和维护系统,这里讲下如果没有这样的条件又感兴趣的话可以在自己的电脑上安装相应的Linux系统来练习一些常用操作命令和做简单的分析。其中Bio-Linux是基于Ubuntu开发的含有大量常用生物信息学软件的Li[……]

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2.2 服务器集群简介

五月 28, 2015 Linux por DeanGao

单个Linux服务器的计算能力很存储能力是有限的,尤其是在像生信信息学这样的计算密集型和存储密集型学科中,需要有更加强大的计算能力和更大更快的存储能力,像各个超级计算机中心的很多一部分的用户都是与生物信息学相关的。后面也会讲到如何在集群上进行与计算作业相关的操作,如何在服务器上高效的进行计算。Lin[……]

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