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DeanGao por DeanGao

4.2 基本数理统计知识

六月 26, 2015 生物信息 por DeanGao

这一节主要是给大家罗列下在生物信息学中经常会碰到的一些数理统计问题,数理统计的内容如果往详细了讲那不是一两篇博客可以讲完的,所以这里是先让大家有个概念和印象,后面可以有针对性的深入学习。

  • 统计的重要性
  • 基本数字特征
  • 数据分布知识
  • 假设检验
  • 回归分析
  • 方差分析
  • 应用多元[……]

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4.1 基本生物学知识

六月 26, 2015 生物信息 por DeanGao

生物信息学涉及到的生物学问题根据研究领域不同而各不相同,由于个人的生物学知识有限和所做过的生物信息分析有限,这里就简单列举下我觉得很基础的生物学知识。

  • 基本生理生化知识
  • 基本基因组学知识

基本的生理生化知识这里就不详细讲了,有兴趣的可以联系我,把你认为很重要的东西列举上去。[……]

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3.5 常用效率工具简介

六月 23, 2015 生物信息 por DeanGao

上一节提到了生物信息分析中一个良好的习惯以及操作规范化的重要性,那么如何去进一步实践呢,这里从各种笔记应用、文献管理、邮件应用、云盘应用、文本编辑器、浏览器以及图片处理工具等方面简单介绍了如何利用现有的优秀工具来对我们的日常工作进行规范和提供工作效率(如下图所示)。更加详细的介绍请阅读我之前的博客《[……]

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3.4 软件安装、数据存放、分析流程编写规范

六月 23, 2015 生物信息 por DeanGao

 

此章节是希望大家在平时的生物信息学分析过程中有规范化的意识,主要是从软件安装、数据存放和流程编写三个方面讲解。

  • 公共软件统一安装到指定目录、公共数据统一存储到指定目录,并且做好记录工作。
  • 安装软件(或存储数据)前先查看相关记录,再决定是否安装(存储)或者更新。[……]

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3.3 资料整理汇总习惯

六月 23, 2015 生物信息 por DeanGao

  • 有人说——“用一个概括这个世界,那就是分类”,男的、女的、老的、少的、做植物的、做动物的、高年级、低年级、BP、MF、CC …
  • 将资料、所要做的事、完成的事做好分类,让一切都有条不紊,这样才能更好的提高效率。
  • 有时候有点强迫症是好的。

既然称之为习惯,那么就不是一[……]

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3.2 任务命令记录习惯

六月 17, 2015 生物信息 por DeanGao

我记得我刚进实验室课题组的时候,老师就跟我强调了这个习惯,当时可能什么都不懂也没用马上接触一些项目,所以没有这个意识,但是后面发现这是很有必要的,尤其是后面慢慢从软件工程的角度来理解这个问题。下面从几点来讲解下:

  • 通常大部分的分析流程不是一步就可以到位的,有时候可能需要返工,同时也要考虑对后[……]

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3.1 信息检索习惯

六月 17, 2015 生物信息 por DeanGao

现在的网络上到处都是各种信息,所以大家在平时学习一些知识的时候没有不要完全去看书。有些东西不懂了不要习惯性的什么都不去思考,一点工作都不做就去问别人,我始终觉得这是一种很不礼貌的行为,说的不好听点——这就是“拿来主义”,如果别人知道那可能会觉得别人还行,要是不了解那就否认别人的能力。所以掌握基本的信[……]

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