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【转载】专访王茂军:棉花科研蓓蕾初绽放

三月 8, 2017 生物信息 por DeanGao

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【转载】【特别关注】一个人•一团队•一支棉

三月 8, 2017 生物信息 por DeanGao

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【公告】

八月 19, 2016 生物信息 por DeanGao

        感谢各位网友一直以来对网站的关注和支持,但是自毕业后就从事了数据分析工作而非生物信息相关工作,没有精力维护和更新网站上相关博文,所以今天我做了个艰难的决定–网站上不再更新生物信息相关的博文,但是网站上之前的博文继续保留。

        回想自己从开始接触生物信息学相关的知识[……]

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5.1.2 常用软件使用介绍

七月 16, 2015 生物信息 por DeanGao

目录

  • 长序列比对

blast
blast+
blat

  • NGS数据介绍及预处理

sratoolkit
fastx-toolkit
FastQC
Trimmomatic

  • 短序列(reads)比对

bowtie(bowtie2)
[……]

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5.1 基本概念与软件简介

七月 13, 2015 生物信息 por DeanGao

生物信息学中有一些最基本的概念和常用的软件,其中常用的生物信息学文件格式是后续进行其它分析的基础,也是提高行业分析规范度的基础,所以清楚的了解基本的文件格式对进一步理解生物信息学这个行业是有帮助的;同时在生物信息学的各个领域也有一些常规的分析工具,掌握这些工具的安装、调试以及使用是必须的,在这个过程[……]

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5.1.1 常用生物信息学格式介绍

七月 10, 2015 生物信息 por DeanGao

前言
fasta
fastq
gff2
gtf(gff2.5)
gff3
bed
sam、bam

vcf

前言
在各个行业都是有行业标准的,这样才能统一规范而方便后面的分析,在生物信息学领域中主要是各种大量序列数据、注释数据等,这些都是有特定的格式[……]

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4.3 Perl编程语言介绍

六月 26, 2015 Perl, 生物信息 por DeanGao

写在最前面:

本节将详细地讲解如何去掌握生物信息学分析中一门常用的编程语言——perl,并结合相应的例子来强化perl编程学习。对于没有计算机编程知识的人来说,学习一门编程语言的过程是痛苦并漫长的,尤其是对学生物的人,

1. 为什么要学编程?
2. 为什么选择perl?
3. Per[……]

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