4.1 基本生物学知识

六月 26, 2015 生物信息 por DeanGao

生物信息学涉及到的生物学问题根据研究领域不同而各不相同,由于个人的生物学知识有限和所做过的生物信息分析有限,这里就简单列举下我觉得很基础的生物学知识。

  • 基本生理生化知识
  • 基本基因组学知识

基本的生理生化知识这里就不详细讲了,有兴趣的可以联系我,把你认为很重要的东西列举上去。这里强调下基本的分子生物学及基因组学知识,因为后续主要是对高通量测序进行分析,大都是与基因组学知识相关。下图列举了典型的基因组序列特征,可能好多人现在对基因组序列上面的一些元件等都不是很熟悉,即使说自己已经在做生物信息学分析了,所以有时候还是要对概念性的东西理解通透。要掌握常见的知识点及缩写,比如:CDS、cDNA、BAC、 AS(Alternative Splicing)、ESTs、TF、TE、mRNA、miRNA、alignment、reference、transcripts、Assembly、Contig、Scaffold、Chromosome、N50、Reads、RPKM、FPKM、single end、 pair end等。

 

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